實驗室設備的種類用很多，用途也不一樣。必須要按照指南來小心使用。
一、植物總DNA提取設備配置
提取植物總DNA的主要設備為：砂漿、液氮罐、電熱恒溫水浴、小容量離心機、大容量離心機、冰箱、紫外分光光度計等。
二、PCR反應系統設備配置
實驗室應能進行PCR反應實驗，一般采用以下實驗設備：超凈操作平臺、渦流振蕩器、小容量離心機和PCR儀。由于PCR技術的改進，也降低了環境的要求，為方便起見，許多人不在無菌平臺上進行PCR反應。但是，超凈操作平臺仍然是分子實驗室必不可少的儀器，許多實驗都必須在超凈操作平臺上進行。
三、凝膠電泳及顯色系統設備配置
凝膠電泳系統的主要功能是檢測提取的總DNA質量和PCR擴增產物。整個過程需要電泳儀、電泳槽、微波爐、振動篩、膠盆、燈箱、紫外線燈和一些常規的小工具。
四、凝膠成像及數據處理系統設備配置
為了能夠觀察、記錄實驗過程、永久保存實驗結果和處理和分析大量分子數據，凝膠成像、圖像存儲和數據處理系統是必需的。在分子植物育種實驗中，分子數據的獲取和分析是分子育種的核心環節。只有得到的分子和表型數據的數據可以得到充分和徹底的分析，從而在實際育種中可以獲得更有效的使用。該系統主要包括凝膠成像系統、掃描儀以及各種生物應用軟件。
五、其它的常規設備
分子生物學實驗對實驗操作環境和反應溶液具有較高的要求。首先，實驗用水水質好，純度高。大部分的實驗水都要求是超純水.因此，有必要配置純水裝置和超純水裝置。第二，無菌環境。離心管、頭端、一些配備溶液的容器和許多溶液必須經過滅菌和滅菌。因此，分子實驗室也需要高壓釜和干燥箱。必須始終在無菌條件下進行大量的實驗步驟，因此無菌手術臺是不可缺少的。此外，溶液的取樣、pH值和純度應準確。因此，高精度電子天平和pH計是用于分配的必要儀器，磁力加熱攪拌器是良好的輔助裝置。還有一個吸管，是一種精密的取樣儀器。根據取樣量的要求，可選擇不同取樣尺寸的吸管分子。這就需要一個良好的制冷系統，一般的分子實驗室有一個溫度為4°；C和-20°；C的冰箱，最好的是-70°；C。
六、易耗品
作為一個分子實驗室，有相當多的消耗品。這里我們主要指一些消費量大的產品。首先是手套。在該實驗室中，無論手套是否有毒，無論何時戴上手套，原則上，無論是否接觸，手套的使用都是相當可觀的。第二，針頭和針頭盒。針尖與吸管一起用于移動溶液、樣品等。還有離心管和離心管支架，實驗室必須與離心機和PCR儀配套，離心管支架也必須與離心管配套。最后，一張玻璃片、一把梳子、一條膠帶和一個夾子，視實驗室的電泳槽而定，通常會配備一些，但這些數量一般不夠，必須單獨購買。
實驗室設備使用時必須十分小心，務必按照使用指南來操作